继承前作剧情，海鸥学园的七大不可思议平衡因“虚假的替身”事件而开始崩坏。花子君和八寻宁宁发现，怪异们变得暴躁并开始无差别攻击学生。新的转校生柚木司（花子君的孪生弟弟）登场，他宣称要重置所有怪异，让学园陷入真正的“彼岸”。宁宁发现自己的寿命进一步缩短，花子君为了拯救她，必须收集四散的“原罪之镜”碎片。过程中，他们了解到七大不可思议的起源都与一场百年前学园祭祀惨案有关。花子君曾亲手封印弟弟，而弟弟的怨恨正通过操控怪异吞噬现实世界。第二季以一场全校被困在无限循环的放学后黄昏为高潮，花子君不得不做出牺牲自己换回宁宁的抉择。
第二季全面升级了黑暗奇幻风格，战斗作画流畅度大幅提升。情感线更加纠结虐心，宁宁与花子君“人鬼殊途”的宿命感被推到极致。对校园怪谈的重新解构脑洞大开，既保留温馨日常又增添了成人向的沉重。
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